O vale de Děčín foi povoado já no Neolítico, e a partir daí tem conhecido, no decorrer dos séculos, povoações de muitas culturas diferentes. A primeira noção sobre Děčín data do ano 993 devido a antiga fortaleza dos Priemislitas. Nos meados do século XIII substituíram-na pelo castelo de pedra, em cujos arredores cresceu uma cidade real. O evento, que influenciou de maneira mais significativa o desenvolvimento dessa região no século XIX, foi a inauguração do caminho de ferro entre Praga - Podmokly - Dresden, em 1851.
Na margem esquerda do rio Labe, onde tinham existindo apenas vilas e municípios separados, dos quais a Podmokly era a mais importante, no século XIX cresceram muitas instalações industriais. O crescimento da região deve sobretudo aos proprietários locais de quintas e terrenos, entre os quais destaca František Antonín Thun - intelectual, economista e progressista. Por volta de 1880, a vila de Podmokly superou Děčín tanto em termos da população como em termos do desenvolvimento industrial. Devido ao desenvolvimento organizado das novas casas e instalações no município, o concelho de Podmokly passou a representar um dos melhores conjuntos arquitectónicos de Arte Nova na Boémia, de carácter único em termos de consistência e dimensão.
Em Outubro 1942, os municípios de Děčín, Podmokly e Staré Město juntaram-se e deram origem a uma nova cidade. Hoje a população de Děčín totaliza 53.000 habitantes, e a cidade, além de ser um centro importante de transporte, comércio e administração, passou a ser também um dos mais importantes alvos turísticos da Boémia do Norte, sobretudo graças à paisagem pitoresca.
