Det er først og fremmest i Prag, hvor der findes en række af betydningsfulde kirkelige monumenter af forskellige arkitektoniske stilarter og konfessioner. Det berømteste, der danner også Prags karakteristiske vartegn, er Skt. Vitus, Václav og Adalberts domkirke (Katedrála sv. Víta, Václava a Vojtěcha), hvis historie går tilbage til den tjekkiske konge og tysk-romerske kejser Karl den IV, som fik Prag gjort til ærkebiskopsæde og lod domkirken bygge her for at markere denne begivenhed. Hovedarkitekter af den gotiske domkirke i den franske stil var Matyas d´Arras og Peter Parler. I begyndelsen af 1400-tallet gik byggeriet af domkirken istå, og den blev først bygget færdig 600 år senere af Forening for Skt.Vitus fuldbyrdelse (Jednota pro dostavění chrámu svatého Víta). Domkirken blev højtideligt indviet på Skt Václavs navnedag i anlednig af tusindårsjubilæum af helgenes død. Kirkens helligdom er Skt. Václav-kapellet, hvor tjekkiske kronjuvelerne opbevares. Domkirken er ikke kun et kongeligt skatkammer, men også et kongeligt gravmæle, hvor der ligger begravet en række af betydningsfulde personligheder af national og europæisk historie.
Prags og med det samme Tjekkiets kendste valfartssted er Maria Sejr-kirken (kostel Panny Marie Vítězné). Denne tidlig barokke kirke ligger i Karmelitská-gaden på Lillesiden. Pilgrimmenes opmærksomhed tiltrækker især den lille statue af Pragerjesusbarnet (Pražské Jezulátko), der er i hele verden kendt som „Bambini di Praga,“ og står på et alter i højre side fra år 1628. Statuen er placeret i en sølvkiste og dens „garderobe“ består af værdifulde broderede og smykkede små frakker i alle farver. Den værdifuldste broderede selv den østriske kejserinde Maria Theresia. . Denne renæssance-voksdukke stammer fra Spanien og det var adelskvinde Polyxena af Lobkovicz, som denne forærede karmelitanerorden.
Til de ældste klostre i Prag regnes Břevnov benediktinerklostret, Strahov præmonstratenserklostret og kapucinerklostret med Loreta-kirken. Den sidsnævnte er især kendt på grund af sit barokke klokkespil og skatkammer med Loreta-skatten. Man skal ikke glemme at nævne andre betydelige kirkelige monumenter såsom Skt. Nikolaj kirke på Lillesiden (chrám sv. Mikuláše), som blev opført af far og søn Dientzenhofer i højbarokstil i 1700-tallet, Prags næststørste bygningkompleks Klementinum, opført i barokstilen der tidligere blev brugt som jesuiterkloster og hvis byggeri varede næsten 200 år. Det er også Bethlehemskapellet, der har en betydningsfuld position i Prags historie, fordi det var her, hvor universitetet Magister Johannes Hus prædikede i 1400-tallet og derfor er kapellet blevet til et symbol på hussittisk og protestantisk bevægelse i Tjekkiet.
Den gamle jødiske Bydel består af Den gamle jødiske kirkegård, rådhuset, ceremonisalen og seks synagoger: Den Gamle-nye, Pinkas´, Maisels, Spansk, Klaus´og Den Høje synagoge. Den oprindelige jødiske bydel opstod i 1200-tallet, men dens nuværende udseende er resultatet af en ombygninger fra slutningen af 1800-tallet og begyndelsen af det 20. århundrede. På trods af at det lykkedes at bevare kun nogle af de vigtigste monumenter i bydelen, der minder om den hundredeårs lange historie af Prags Jøder, danner denne en af de best bevarede jødiske monumenter i Europa.
