Das im Jahr 1878 gegründete Museum verwaltet einige ständige Expositionen in Znojmo und der Umgebung. In der Burg Znojmo mit einer wertvollen Rotunde der hll. Maria und Katharina befindet sich eine historische Exposition und ein Lapidarium. Im Minoritenkloster sind naturwissenschaftliche, archäologische und numismatische Sammlungen sowie eine einmalige Kollektion orientalischer Waffen. Das Museum verwaltet auch die Burg Cornštejn und die P.-Diviš-Gedenkstätte in Přímětice.